Начнём с того, в каких случаях нужно делать переустановку:
1. Ваш сервер не запускается после изменений, а бэкап сервера к сожалению вы не сделали.
2. Сервер уходит постоянно в краш.
3. Смена сборки (билда).
4. Переход на другую сборку.

Как сделать переустановку? Все просто:
1. Переходим в Управление сервером.
2. Выключаем сервер.
3. Жмем Переустановить.